克里斯托弗·比尔格

克里斯托弗·比尔格

CSB编程主任;生物学教授; kiicr的校外构件; Broad研究所的准会员

克里斯托弗·比尔格应用的实验和计算方法的结合来了解潜在的预mRNA剪接和其他类型的转录后基因调控的监管码。

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教育

  • 博士,1997年,斯坦福大学
  • BS,1990年,生物科学,斯坦福大学

研究综述

我们的目标是理解RNA剪接的代码:如何内含子的剪接位点的精确位置在初级转录本进行识别和如何它的特殊性在不同的细胞类型的变化。为此,我们正在映射几十人RNA结合蛋白的RNA结合亲和力光谱和与体内结合和活动数据这一信息集成。我们也在研究3’ 非翻译区的功能,包括其mRNA的定位和微小RNA调控作用。该实验室使用的计算和实验的方法来解决这些问题的组合。

奖项

  • 先灵葆雅研究所奖(ASBMB),2007年
  • 奥弗顿奖计算生物学(iscb),2001年

主要出版物

  1. 远端的替代外显子最后的mRNA本地化神经预测。 托利弗,JM,vidaki,米,Oliveira的,R,奥尔森,S,詹,L,Saxena先生,T,Wang,等,graveley,BR,格特勒,FB,斯万森,毫秒 等。。 2016摩尔。细胞61,821-33。
    DOI: 10.1016 / j.molcel.2016.01.020结论:26907613
  2. 在哺乳动物组织中的基因和同种型调节的进化动力学。 梅尔金,J,罗素,C,陈,P,比尔格,CB。 2012年理科338,1593-9。
    DOI: 10.1126 / science.1228186结论:23258891
  3. 前mRNA剪接的全转录调控和通过的muscleblind蛋白mRNA定位。 Wang,等,科迪,NA,慢跑,S,biancolella,米,旺,TT,Treacy的,DJ,洛,S,Schroth谈到,GP,豪斯曼,DE,雷迪,S 等。。 2012.小区150,710-24。
    DOI: 10.1016 / j.cell.2012.06.041结论:22901804
  4. 替代同种型调节在人体组织中转录。 Wang,等,Sandberg的,R,洛,S,khrebtukova,I,章,L,迈尔,C,kingsmore,SF,Schroth谈到,GP,比尔格,CB。 2008年自然456,470-6。
    DOI: 10.1038 / nature07509结论:18978772
  5. 增殖细胞表达具有缩短的3' 非翻译区和较少的微小RNA靶标位点的mRNA。 Sandberg的,R,尼尔森,JR,SARMA,一个,锋利,PA,比尔格,CB。 2008年理科320,1643-7。
    DOI: 10.1126 / science.11​​55390结论:18566288

近期出版物

  1. 外显子介导的转录启动的激活。 fiszbein,一,克里克,KS,贝格,是比尔格,CB。 2019细胞179,1551-1565.e17。
    DOI: 10.1016 / j.cell.2019.11.002结论:31787377
  2. 在大脑中的microRNA中cotargeting。 cherone,JM,jorgji,V,比尔格,CB。 2019年基因组资源。 29,1791至1804年。
    DOI: 10.1101 / gr.249201.119结论:31649056
  3. 采集的混合E / M状态为基础的乳腺癌细胞的致瘤性是必不可少的。 克罗格,C,afeyan,一个,玛耶兹,J,伊顿,EN,Reinhardt的,F,khodor,基,瑟尔,P,bierie,B,叶,X,伯奇,CB 等。。 2019年PROC。国家科。 ACAD。 SCI。美国。 116,7353-7362。
    DOI: 10.1073 / pnas.1812876116结论:30910979
  4. 在基质的边界驱动肿瘤的酸化转录与侵袭性表型相关的改变。 鲁哈尼,N,豪升,亚历,MS,joughin,BA,krismer,K,moufarrej,MN,SOLTIS,AR,lauffenburger,DA,YAFFE,MB,伯奇,CB 等。。 2019年癌症研究。 79,1952年至1966年。
    DOI: 10.1158 / 0008-5472.can-18-1604结论:30755444
  5. 核糖体相关联的广泛的积累在分离大脑老化的神经元细胞群的3' 非编码区。 sudmant,pH值,李,H,格斯,d,海曼,米,比尔格,CB。 2018细胞代表25,2447-2456.e4。
    DOI: 10.1016 / j.celrep.2018.10.094结论:30485811
  6. 众多的递归网站有助于拼接的精度长内含子的苍蝇。 PAI,AA,paggi,JM,炎,P,阿德尔曼,K,比尔格,CB。 2018年公共科学图书馆·遗传学。 14,e1007588。
    DOI: 10.1371 / journal.pgen.1007588结论:30148878
  7. 前mRNA剪接中的动力学 果蝇 基因组和基因结构的影响。 PAI,AA,利克斯,T,麦丘,K,伯克霍尔德,一个,阿德尔曼,K,比尔格,CB。 2017年6网上生活。
    DOI: 10.7554 / elife.32537结论:29280736
  8. 对于中东和北非地区的要求,肌动蛋白调节,在发育中神经元的本地mRNA的翻译。 vidaki,米,Drees酒店,F,Saxena先生,T,lanslots,E,托利弗,MJ,tatarakis,一个,伯奇,CB,Wang,等,格特勒,FB。 2017年95神经元,608-622.e5。
    DOI: 10.1016 / j.neuron.2017.06.048结论:28735747
  9. 在体外测量RNA序列背景效应预测体内蛋白结合和调节。 托利弗,JM,兰伯特,NJ,sudmant,pH值,格斯,d,梅尔金,JJ,亚历,MS,bazile,C,比尔格,CB。 2016摩尔。细胞64,294-306。
    DOI: 10.1016 / j.molcel.2016.08.035结论:27720642
  10. 3' 非翻译区的普遍缩短,增加了外显子内含的进化上保守的先天免疫反应,感染的特征。 PAI,AA,baharian,G,页萨布林,一个,Brinkworth填入,JF,nédélec,Y,拟音,JW,格雷尼尔,JC,siddle,KJ,dumaine,一个,yotova,V 等。。 2016年公共科学图书馆·遗传学。 12,e1006338。
    DOI: 10.1371 / journal.pgen.1006338结论:27690314
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