艾米即基廷

艾米即基廷

生物学和生物工程教授

艾米即基廷确定蛋白质如何使彼此特异性相互作用和设计新的合成蛋白质 - 蛋白质相互作用。

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教育

  • 博士,1998年,美国加州大学洛杉矶分校
  • SB,1992年,物理,哈佛大学

研究综述

我们的目标是理解,在高层次的细节,如何蛋白质的相互作用特性在序列和结构进行编码。我们通过与生物化学和生物物理实验整合高通量检测,结构建模和生物信息学数据研究蛋白 - 蛋白相互作用。许多我们的工作着重于α螺旋卷曲螺旋蛋白,bcl-2的凋亡调节蛋白和蛋白质结构域,其结合到短的线性基序。 艾米·基廷目前在休假。 

主要出版物

  1. 在PUMA上位突变BH3驱动的替代结合模式强效和选择性抑制抗凋亡BFL-1。 简森,JM,瑞安,JA,批,RA,勒泰,一,基廷,AE。 2017年6网上生活。
    DOI: 10.7554 / elife.25541结论:28594323
  2. 数据驱动的预测和的bZIP卷曲螺旋相互作用的设计。 波塔波夫,V,卡普兰,JB,基廷,AE。 2015年公共科学图书馆COMPUT。生物学。 11,e1004046。
    DOI: 10.1371 / journal.pcbi.1004046结论:25695764
  3. sortcery-高通量方法,以亲合性等级的肽配体。 帝国,LL,杜塔,S,基廷,AE。 2015年学家摩尔。生物学。 427,2135-50。
    DOI: 10.1016 / j.jmb.2014.09.025结论:25311858
  4. 设计BH3肽以高亲和力和特异性针对细胞靶向MCL-1。 foight,GW,瑞安,JA,gullá,SV,勒泰,一,基廷,AE。 2014年,ACS化学。生物学。 9,1962-8。
    DOI: 10.1021 / cb500340w结论:25052212
  5. bZIP结构蛋白质 - 蛋白质相互作用的网络多元化超过十亿年的进化。 赖因克,AW,BAEK,J,ashenberg,O,基廷,AE。 2013年理科340,730-4。
    DOI: 10.1126 / science.1233465结论:23661758

近期出版物

  1. 三级结构基序序列的统计数据使能容易预测和结合抗凋亡BFL-1和Mcl-1的肽的设计。 frappier,V,詹森,JM,周,J,Grigoryan的,G,基廷,AE。 2019年结构27,606-617.e5。
    DOI: 10.1016 / j.str.2019.01.008结论:30773399
  2. 通过在数据参数化蛋白质相互作用景观优化肽设计。 詹森,JM,雪,V,stretz,L,曼德尔,T,帝国,LL,基廷,AE。 2018年PROC。国家科。 ACAD。 SCI。美国。 115,e10342-e10351。
    DOI: 10.1073 / pnas.1812939115结论:30322927
  3. pixeldb:用肽结合模式的结构保守注释蛋白 - 肽复合物。 frappier,V,杜兰,米,基廷,AE。 2018年SCI蛋白质。 27,1535年至1537年。
    DOI: 10.1002 / pro.3431结论:30251349
  4. 迭代优化产率MCL-1靶向与选择性细胞毒性钉肽与Mcl-1的依赖性癌症细胞。 雷扎伊ARAGHI,R,鸟,GH,莱恩,JA,詹森,JM,戈德斯,米,pritz,JR,准许,RA,乐泰,一个,walensky,LD,基廷,AE 等。。 2018年PROC。国家科。 ACAD。 SCI。美国。 115,e886-E895。
    DOI: 10.1073 / pnas.1712952115结论:29339518
  5. pixeldb:用肽结合模式的结构保守注释蛋白 - 肽复合物。 frappier,V,杜兰,米,基廷,AE。 2018年SCI蛋白质。 27,276-285。
    DOI: 10.1002 / pro.3320结论:29024246
  6. 使用正交相互作用卷曲螺旋的蛋白质nanotriangle的模块化装配。 公园,WM,bedewy,男,伯格伦,KK,基廷,AE。 2017年SCI代表7,10577。
    DOI: 10.1038 / s41598-017-10918-6结论:28874805
  7. 在PUMA上位突变BH3驱动的替代结合模式强效和选择性抑制抗凋亡BFL-1。 简森,JM,瑞安,JA,批,RA,勒泰,一,基廷,AE。 2017年6网上生活。
    DOI: 10.7554 / elife.25541结论:28594323
  8. 富集肽文库,用于通过计算针对文库设计的结合亲和力和特异性。 foight,GW,陈,TS,里奇曼,d,基廷,AE。 2017年的方法摩尔生物学。 1561年,213-232。
    DOI: 10.1007 / 978-1-4939-6798-8_13结论:28236241
  9. 组合的bZIP二聚体显示复杂的DNA结合特异性的景观。 罗德里格斯马丁内斯,JA,Reinke的,AW,bhimsaria,d,基廷,AE,安萨里,AZ。 2017年6网上生活。
    DOI: 10.7554 / elife.19272结论:28186491
  10. 与酵母表面展示和sortcery高通量产生高精度肽结合的数据。 帝国,LL,杜塔,S,基廷,AE。 2016年的方法摩尔生物学。 1414,233-47。
    DOI: 10.1007 / 978-1-4939-3569-7_14结论:27094295
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