简介:罗汉jonnalagadda

锻造含金属的蛋白质的新的理解

Person in lab

研究生罗汉jonnalagadda分析含铁酶的三维形状来解析其在细胞过程的作用。

罗利mcelvery

 

在一个熟悉电脑的家庭在软件和信息技术精通提高,罗汉jonnalagadda有一个强烈的愿望,“解码”他周围的世界。但他种代码,所述遗传一个,包括四个重复的字母:A,T,C和G。 “就像在软件的电脑上运行,我想研究分子的硬件,使人们产生的生活后面的代码,”他说。现在六年级研究生在 卓尔实验室,他的作品解密含金属蛋白质的结构,以确定他们在重要的细胞反应扮演的角色。

当jonnalagadda是在加州ag真人平台生物化学专业,大学伯克利分校,很清楚地告诉他,遗传密码是不仅仅是一个字母串;它也可作为蓝本,在整个机体的所有蛋白质。这些蛋白质折叠成复杂的三维结构,这最终招致功能。

加州大学伯克利分校,他加入了一个实验室研究含铁蛋白血红素一氧化氮/感测的一氧化氮气体在细菌和真核细胞中的氧(H-NOX)。当h硝结合于一氧化氮,它必须改变其3D形状中的过程。 jonnalagadda使用被称为X射线晶体学的技术以冻结在该构象改变的各个阶段的h-nox的 确定 如何其所结合的气体分子。

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使用X射线晶体学,jonnalagadda芽的x射线在他的蛋白质的晶体。作为与晶体相互作用束,他们创建像这里示出的一个,和一个计算机识别和记录的图案的衍射图案。

通过他在ag真人平台注册生物学毕业,开始了他的博士学位时,jonnalagadda已经使用了两年多的X射线晶体学。今天,作为成员 凯瑟琳卓尔的实验室,他继续利用此来解析附加含金属蛋白质的结构相同的方法。

“我认为,我们有时会忽略一个事实,即我们需要微量金属,为了生存,”他说。 “我感兴趣的是不断思考什么不同的金属可能在细胞做。并使用金属开辟了化学反应的一个全新的世界,你一般不会在课堂上学习“。

其实,这两个项目是他倾注了他的大部分时间在过去的五年中涉及的反应,他甚至从来没有听说过他在ag真人平台注册到来之前。他的第一承诺的重点是酶核糖核苷酸还原酶含铁(RNR),这有助于产生脱氧核糖核苷酸,DNA的构建块。

jonnalagadda旨在了解这种酶是如何被调控,以保证细胞维持每种类型的脱氧核糖核苷酸适量,以正确地复制和修复其基因组。如果这些比例不正确,电池可能会遇到不利的压力。

因为酶在人体中不同的管制比在细菌,科学家们希望有朝一日创建针对细菌RNR同时使人类RNR毫发无损抗生素。 jonnalagadda的工作原理与人类版本,制定一个试验,让他更好地评估这两种酶之间的差异。 RNR是出了名的难以与工作等等jonnalagadda花的太多他的时间的发展道路,因此保持稳定,净化它。

他的第二个项目是与研究人员在母校,加州大学伯克利分校,调查异腈协作 - 包含碳原子了两倍结合到氮原子的化合物。因为异腈可用于制造药物,如抗生素,科学家们在探索新的方式来生产它们产生了浓厚兴趣。该研究小组发现,一种细菌, 天蓝淡红链霉菌,有合成这些化合物的新的和神秘的方式。 jonnalagadda想知道这些特定的细菌究竟是如何做到这一点。

他是用X射线晶体学确定的含铁酶scoe在结构 秒。天蓝淡红, 其负责形成异腈的碳 - 氮三键的特性。

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计算机使用X射线衍射图案来计算地图上的蛋白质的电子密度(蓝色目)。蛋白质(黄色)的模型是建立在电子密度匹配尽可能地不违反约束生化。

“这是令人兴奋的合作上只是刚刚被发现的蛋白质,”他说。 “这里只有这么多,了解其基本的生物学功能。我想这就是为什么基础研究是如此吸引我。你永远不知道在哪里工作都会带着你,或者影响其可能对人体健康以后。”

扩展任何学科的前沿需要一些猜测和隐喻bushwhacking,并jonnalagadda已经从他的失败的实验得知几乎一样多,因为他从他成功的了。 “我很自豪的是,我已经能够用我所了解的实验设计,帮助别人在我的实验室里,当他们有问题,”他说。

他认为生命毕业后,他希望用他掌握了生化和结构技术,多年来,以确保在行业中的工作。

“是这样的宽广和广泛的研究兴趣部门的一部分,取得了很容易地看到我的工作不存在于真空中,”他说。 “它连接到生物学的许多不同的方面。”

图片来源:罗利mcelvery
发布19年8月23日

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